由贝勒医学院和科技公司 SandboxAQ 的科学家组成的团队开发了一种基于片段的方法来检测分子胶。他们说这个工作流程发表于 沟通自然 9 月 12 日，一种更便宜、更容易的方法来寻找将两种蛋白质结合在一起的小粘性分子 (DOI: 10.1038/s41467-026-77657-z)。
贝勒团队首先使用高通量蛋白质组学筛选苯基戊二酰亚胺靶向片段库，以检测 VAV1（一种免疫相关信号蛋白）的降解活性。筛选过程分析了用片段处理细胞后细胞蛋白质组的变化，该筛选过程产生了两个分子。
这两种分子被称为化合物 11 和 12，最初作为降解剂的能力非常弱。但我们的目标并不是立即找到最好的 VAV1 降解剂；而是要立即找到最好的 VAV1 降解剂。我们的策略是扫描一个小型库，寻找任何可以开发的热门产品，以更好地粘合生产线。
这就是 SandboxAQ 的用武之地。它模拟了配体和 VAV1 蛋白之间的相互作用，让科学家深入了解如何修改化合物以提高其粘附力。
“我们喜欢从片段开始的原因是因为用较小的分子覆盖化学空间相对容易。然后你会得到微弱的打击。然后你开始进化它们，”贝勒下一代治疗中心主任 Jin Wang 说。 “我想说，这更具成本效益，也更可行。”
SandboxAQ 药物发现副总裁 Andrea Bortolato 表示：“我们至少有一个证据表明我们可以实现基于片段的分子胶药物发现，这非常令人兴奋。”
SandboxAQ 是一家从谷歌母公司 Alphabet 剥离出来的人工智能软件公司。这并不是该公司第一次涉足人工智能驱动的药物发现领域。它与阿斯利康、赛诺菲和加州大学旧金山分校现有合作伙伴关系。
